Фамилия Алифер — один из тех редких случаев, когда на слух она звучит как иностранная, а по происхождению оказывается чисто русской, перекроенной народным произношением. В её основе лежит крестильное имя Елевферий, которое в переводе с греческого означает «свободный». Длинное и неудобное для повседневной речи, это имя в просторечии сокращали и переделывали до неузнаваемости: так появились цепочки Левфер, Лихвер, Алихвер и, наконец, Алифер. Фамилию образовали именно от последнего варианта, и здесь скрыта главная особенность.

Обычно русские фамилии строятся по модели «основа + суффикс принадлежности (-ов/-ев, -ин)», но Алифер стоит особняком. Это так называемая «усечённая» или «бессуффиксная» фамилия, где типичное окончание со временем отпало, и она застыла в виде чистой основы. Фактически, Алифер — это «сын Алифера», то есть потомок человека, которого в быту звали Алифером вместо Елевферия. Такая форма встречается редко и часто указывает на позднюю фиксацию фамилии или на то, что прозвище сразу стало родовым именем без добавления суффикса. Подобные бессуффиксные варианты особенно характерны для южнорусских и украинских регионов, где фамилии нередко оканчивались на согласный.

Существует и вторая, менее вероятная версия, связывающая фамилию с тюркским словом «алиф» (первая буква арабского алфавита) или с арабским именем Алиф. Однако против этого говорит отсутствие характерных тюркских суффиксов, а главное — широкая распространённость имени Елевферий в православных святцах. Фамилии от церковных имён, искажённых в народе, — массовое явление (вспомните Евдоким — Овдоким, Ирина — Арина). Алифер вписывается именно в этот ряд, и тюркская версия выглядит натянутой.

Географически фамилия редкая, встречается точечно. Основные очаги — бывшие южные губернии России и Украина, где греческие имена переделывали особенно смело. В дореволюционных переписях форма Алиферов (с окончанием -ов) встречается чаще, чем Алифер, что подтверждает: исходная форма была с суффиксом, а современное написание — результат упрощения. С точки зрения социального контекста, носители фамилии, скорее всего, происходили из крестьян или мещан. Дворянские роды редко оставляли фамилии в такой «обрубленной» форме — им было свойственно сохранять книжное звучание имени. А вот в среде, где имя передавалось на слух, Елевферий легко и естественно превращался в Алифера.