Фамилия Алиферов (и её вариант Алифёров) происходит от имени или прозвища Алифер. В основе лежат две версии. Первая связывает фамилию с крестильным именем Елеферий (греческое «свободный»). В народной речи оно превратилось в Алифера или Алифёра — так было проще произносить. Вторая версия выводит прозвище Алифер от слова «олифа» (льняное или конопляное масло для красок). Чередование о/а возникло под влиянием акающих говоров, где безударное «о» звучит как «а». Если верна эта гипотеза, то Алифером называли мастера, который варил олифу — профессиональное прозвище, привязанное к ремеслу.

Фамилию образовали по стандартной русской модели: к основе Алифер добавили притяжательный суффикс -ов, который указывал на принадлежность («чей?» — Алиферов сын, затем просто Алиферов). В документах встречаются оба варианта ударения — на «е» и на «ё». Разница чисто орфографическая: в бытовой записи XIX — начала XX века «ё» часто заменяли на «е».

Судя по записям в Книгах памяти, фамилия была распространена в разных регионах, но заметна в Сибири и на юге России. В Книге памяти Томской области указан Григорий Васильевич Алиферов (1905 г.р., деревня Ущерб Зырянского района). В Курской области — Егор Иванович Алиферов (1900 г.р., село Жуковщина Вилейской области). В Книге памяти Республики Киргизия — Иван Иванович Алиферов (1870 г.р., из Ставропольской губернии). В Омской области — украинец Федор Прохорович Алиферов (1899 г.р., село Новороссийка). География широкая, что типично для фамилий на -ов, не привязанных к одной местности.

Интересная деталь: в основе фамилии лежит имя, которое в церковном календаре звучит как Елевферий. В святцах это редкое имя, поэтому его народные формы — Алифер, Алифёр, Олифер — встречаются нечасто. Соответственно, и фамилия Алиферов не относится к массовым. Если сравнивать её с однокоренными, то можно вспомнить фамилию Елеференко (украинский вариант) или Елиферов — они образованы от той же основы, но с другим оформлением. Алиферов же — чисто русская модель с суффиксом -ов.

Так что, выбирая между версиями, более убедительной выглядит связь с именем Елеферий: переход Елевферий → Алифер типичен для народной этимологии, когда длинное греческое имя упрощали до созвучного и удобного. Версия с олифой возможна, но менее вероятна: прозвище Алифер в значении «маляр» или «олифщик» почти не фиксируется в исторических источниках, в отличие от имени Алифер, которое встречается в переписных книгах.