Фамилия Алиферцева — женская форма фамилии Алиферцев, а та, в свою очередь, образована от имени или прозвища Алиферец. Основа здесь — календарное имя Елевферий (с ударением на втором слоге), которое в русской народной традиции подверглось сильному фонетическому изменению: начальное «Е» перешло в «А», а «в» между гласными выпало или заменилось на «ф». Так Елевферий превратился сначала в Алифер, потом в уменьшительную форму Алиферец. Фамилия означает «потомок Алиферца».

Такая трансформация — не редкость для имён греческого происхождения, которые крестьяне и посадские люди перекраивали на свой лад. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) подобные примеры разбираются: Елевферий дал целый ряд фамилий — Алиферов, Алферов, Алферьев, Олиферов. Алиферцева стоит в этом ряду особняком из-за суффикса -ец, который в русских прозвищах часто указывал на принадлежность к какой-то группе или местности («наш, свой»). То есть Алиферцем могли назвать не просто «маленького Алифера», а, скажем, сына или человека из рода Алиферовых.

По сословной принадлежности фамилия, скорее всего, крестьянская или мещанская. Дворянские роды с таким окончанием (-цев) редки, и обычно они вели происхождение от вотчин или службы, а не от просторечного имени. Географически фамилия встречается в центральных и южных регионах России, особенно в Воронежской, Тамбовской, Рязанской областях — там, где были сильны диалектные формы имён.

Интересная деталь: написание через «и» (Алиферцев, а не Алферцев) говорит о том, что в основе лежала полная, а не стяжённая форма имени. В документах XVII–XVIII веков можно встретить и Алиферовых, и Алферовых, но Алиферцевы — это уже более поздняя, устойчивая фамилия, закрепившаяся в конкретных сёлах. Если искать корни, стоит обратить внимание на исповедные росписи тех губерний — там имя Елевферий нередко записывали как Алифер.