Фамилия Алимкожа — редкий случай, когда в одном слове соединились арабское имя и тюркский титул. Первая часть, Алим, восходит к арабскому «алим» (знающий, учёный), одному из имён Аллаха и распространённому личному имени в мусульманском мире. Вторая часть, кожа, — это казахская и тюркская форма арабского «ходжа» (господин, хозяин, наставник). В дореволюционной Средней Азии и Казахстане так называли потомков пророка Мухаммеда, а также уважаемых купцов и учителей.

По словообразовательной модели это сложение двух основ без добавления русских суффиксов (вроде -ов или -ин). Такая форма характерна для фамилий, которые закрепились в советское время у казахов и других тюркских народов: их не русифицировали, а записывали как есть, по самоназванию. Поэтому Алимкожа — не столько фамилия в русском понимании, сколько составное имя-титул, которое стало наследственным.

Географически фамилия почти целиком привязана к южным регионам Казахстана (Кызылординская, Туркестанская области) и к западу Узбекистана. Если предки носили такое имя, они, скорее всего, принадлежали к духовному сословию (ходжи) или к зажиточным торговцам, которые вели дела на Шёлковом пути. Встречаются и варианты написания — Алимходжа, Алим-ходжа, но в русских документах чаще всего фиксируют слитное Алимкожа.

Интересно, что фамилия не имеет суффикса множественности или принадлежности, как у большинства русских фамилий. Это говорит о том, что её носители долго сохраняли родовую общинную память: имя предка не «присваивали», а передавали как знак статуса. В советских паспортах такое написание закрепилось в 1930–1940-е годы, когда фиксировали национальные формы без переделки на русский лад.

Сегодня Алимкожа — фамилия немногочисленная, но узнаваемая в казахской среде. Её носители нередко подчёркивают связь с исламским образованием и историей региона, хотя прямых документальных подтверждений происхождения от конкретного Алима-ходжи обычно не сохранилось.