Фамилия Алистархов — редкая, и её происхождение напрямую связано с крестильным именем. В основе лежит древнегреческое имя Алистарх (вариант — Аристарх), что значит «лучший начальник» или «превосходный правитель». Форма Алистарх — это народная, упрощённая версия, где первый гласный «и» перешёл в «а» под влиянием акающего произношения, характерного для многих русских говоров. Таким образом, фамилия образована по стандартной патронимической модели: сын Алистарха, то есть потомок человека с этим именем.

Особенность фамилии в том, что она сохранила архаичную форму основы. В церковной среде и в документах XVIII–XIX веков чаще встречалась фамилия Аристархов, а Алистархов — это её бытовой, «простонародный» вариант. Носители фамилии, скорее всего, происходили из крестьянской или мещанской среды, где имя Алистарх было в ходу, но не получило широкого распространения. В дворянских родословных эта фамилия практически не фиксируется, что указывает на её демократичное происхождение.

Словообразовательный суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — Алистархов. Это самая распространённая модель русских фамилий, но в данном случае она сочетается с неканоническим именем. Написание с «а» в начале (Алистархов, а не Аристархов) — ключевой маркер, отличающий эту фамилию от более частотных однокоренных. Если встретится вариант Алистархов, можно с высокой вероятностью предположить, что предки жили в регионах с сильным аканьем — например, в среднерусских областях или Поволжье.

В ономастических справочниках фамилия Алистархов упоминается редко, чаще как вариант к Аристархову. Её редкость — не ошибка, а отражение живой народной речи, где имя «подравнивали» под привычное звучание. Сегодня эта фамилия встречается в основном в центральной России, но остаётся малочисленной.