Фамилия Альпеисова — редкий пример фамилии, образованной от полного арабского имени с прозрачной внутренней формой. Её основа — мужское имя Альпеис, которое представляет собой тюркскую или казахскую адаптацию арабского имени Аль-Файиз (аль-Фаиз). В переводе с арабского «аль-фаиз» означает «победитель», «одержавший верх» или «тот, кто достигает успеха». Таким образом, в основе фамилии лежит не прозвище и не профессия, а личное имя с религиозно-оценочным значением, распространённое в мусульманской среде.

Словообразовательная модель фамилии проста и характерна для русского языка: к основе мужского имени Альпеис добавлен суффикс -ов, а затем окончание -а, указывающее на женский род носительницы. Фамилия Альпеисова — это женская форма; мужская форма будет Альпеисов. Такая модель типична для фамилий, возникших в среде крещёных татар, башкир, казахов или других тюркоязычных народов, перешедших в православие, но сохранивших доисламские или арабо-мусульманские имена. Однако не исключено, что фамилия могла закрепиться и в русскоязычной среде через браки или ассимиляцию.

Географически фамилия Альпеисова встречается в основном в регионах Поволжья, Приуралья и Западной Сибири — там, где исторически компактно проживают татары и башкиры. Встречается она и в Казахстане, но реже, поскольку в казахской ономастике суффикс -ов/-ова обычно не используется, а фамилии образуются через окончания -улы/-кызы или вовсе без них.

Примечательная деталь: фамилия Альпеисова не имеет однокоренных «дублёров» в виде Альпеищев, Альпеискин или Альпеисевич. Это говорит о том, что фамилия возникла относительно поздно, уже в период массовой паспортизации XIX–XX веков, когда администрация фиксировала имя отца как есть, без добавочных прозвищных суффиксов. В отличие от фамилий, образованных от прозвищ или профессий, здесь не было вариативности — просто взяли имя отца и оформили его по русскому образцу.

Версия о том, что основа Альпеис могла быть искажением имени Альфред или Альберт, маловероятна: эти имена не имеют арабской этимологии и не встречаются в тюркской антропонимии до XX века. Правдоподобнее всего именно связь с арабским «аль-фаиз», которое через тюркское посредничество превратилось в Альпеис.