Фамилия Альяных — одна из тех, что сразу выдают свой восточный след. Её основа, скорее всего, тюркская, и связана она с прозвищем Альян. Разбираем это прозвище по частям: «ал» в тюркских языках означает «алый, красный», а «янах» — «щека». Получается описательное прозвище «краснощёкий» — его могли дать человеку с ярким, румяным лицом. Такие прозвища по внешним приметам были очень распространены, поэтому эта версия выглядит самой правдоподобной.

Модель фамилии — на -ых — тоже многое говорит. Это типичный окончание для северных и некоторых центральных областей России (например, Архангельская, Вологодская, Тверская губернии). Фамилии на -их/-ых отвечали на вопрос «чьи вы?» и обозначали принадлежность всему роду: «из дома Альяных». То есть предки носителя этой фамилии были известны в своей округе как «Альяны» — люди из семьи или рода того самого Альяна.

Есть и вторая, менее вероятная версия. Некоторые исследователи возводят фамилию к греческому слову «альян» — кисломолочный напиток. Вряд ли прозвище дали по напитку напрямую, но не исключено, что так могли называть человека, который его готовил или торговал им. Однако тюркская версия с «красной щекой» и общим для региона словообразованием выглядит убедительнее.

Сама фамилия редкая. Её география сегодня — в основном юг России и Сибирь, куда в разное время переселялись крестьяне и казаки. Встречается также в написании Альянов, но форма Альяных — более архаичная, сохранившая родовое окончание.