Фамилия Амиржанова — женская форма от мужской фамилии Амиржанов, которая образована от составного арабско-персидского имени Амиржан. В этом имени первая часть — «амир» (араб. امير — «князь», «повелитель», «военачальник»), вторая — персидский компонент «жан» (جان — «душа», «жизнь»). Вместе имя Амиржан можно перевести как «душа повелителя» или «живой, как повелитель», — типичный для тюрко-персидской традиции комплиментарный антропоним, который давали мальчикам с пожеланием силы и долголетия.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: к основе Амиржан прибавили русский патронимический суффикс -ов, что указывает на принадлежность к роду Амиржана. Такое оформление характерно для фамилий тюркского и мусульманского происхождения, которые в XIX–XX веках адаптировали к русской делопроизводственной традиции в Поволжье, на Урале, в Казахстане и Средней Азии. Если бы фамилия формировалась внутри самого тюркского языка, она могла бы выглядеть как Амиржанулы (казах.) или Амиржанзода (тадж.), но русский суффикс закрепил её в форме Амиржанов.

Географически фамилия Амиржановы наиболее плотно представлена в Казахстане, Башкортостане, Татарстане, а также в Узбекистане. Среди носителей — потомки как оседлого населения (ремесленники, торговцы, муллы), так и кочевой аристократии: имя Амиржан часто встречалось в среде биев и старшин. В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксируется с середины XIX века, преимущественно в Оренбургской и Уфимской губерниях.

Спорных этимологий у фамилии почти нет — корень ясен. Единственная путаница возможна с омонимичным таджикским именем Амирджон, где «джон» — тот же «жан», но в другом диалектном произношении. Однако в русской записи оба варианта могли слиться в одну фамилию, поэтому у части носителей Амиржановых предки могли происходить из Ферганской долины, где форма «джон» преобладает.