Фамилия Ананенков образована от канонического крестильного имени Ананий. Это имя древнееврейского происхождения, его значение — «отмеченный милостью Божией». В основе фамилии лежит одна из народных форм этого имени — Ананенок, которая была распространена в северных и центральных областях России. Суффикс -енок в таких фамилиях указывал на молодого человека или сына: Ананенок — сын или потомок Анания. Со временем форма Ананенок, попав в официальные документы, обросла типичным для многих русских фамилий суффиксом -ов, превратившись в Ананенков. Таким образом, фамилия буквально означает «потомок Ананенка», то есть внук или правнук человека, которого в быту звали Ананенком. Стоит обратить внимание, что эта фамилия — редкий пример модели, где сначала появился «полуотчество» на -енок, а затем к нему добавили патронимический суффикс -ов. В ономастике такой способ словообразования встречается нечасто, и это отличает Ананенковых от более стандартных Ананьевых или Ананиных, образованных напрямую от имени Ананий.