Фамилия Ананишев — редкий случай в русской ономастике, когда церковное имя дало целое гнездо фамилий, но одна из них оказалась на периферии. В основе лежит каноническое имя Ананий, пришедшее из древнееврейского через греческий язык. В Библии Анания — один из трёх отроков, не сгоревших в печи вавилонской; имя означает «благодать Божия» или «Бог милостив». В быту на Руси оно быстро прижилось в просторечной форме Ананиш, от которой и пошла фамилия с патронимическим суффиксом -ев.

Словообразовательная модель проста: Ананиш (разговорная форма имени Ананий) плюс суффикс -ев, указывающий на принадлежность: «сын Ананиша». Это отличает фамилию от более распространённых Ананьев (от Ананий) и Ананин (от Ананя). Суффикс -иш- в основе — характерная черта севернорусских и некоторых среднерусских говоров, где имена часто укорачивали или упрощали для бытового произношения. Сравните: Иван — Иваниш, Трофим — Трофимиш. Такая модель образования — не просто фонетическое изменение, а маркер народной речи, где имя перестало быть книжным и зазвучало по-домашнему.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и центральным областям России. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне и посадские люди с именем Ананишко, что подтверждает народное бытование этой формы. Ананишевы — это потомки не знатного рода, а скорее крестьян или ремесленников, которых в документах записывали по отцу: «Ананишев сын» или просто «Ананишев». Социальный контекст здесь прозрачен: фамилия закрепилась в среде, где патроним был главным способом идентификации человека, а церковная форма имени уступала местному говору.

Любопытная деталь: в некоторых говорах имя Ананий путали с Анисимом, поэтому нельзя исключать, что часть Ананишевых на самом деле ведёт род от Анисима (греч. «исполнение, завершение»). Но это версия слабая — в старых актах форма Ананиш встречается именно как производная от Анания, а не от Анисима. Смешение происходило позднее, уже в XIX веке, при записи в метрики, когда писарь мог записать фамилию на слух, не вникая в этимологию. Опираться на эту гипотезу как на основную не стоит: документальная традиция XVII века указывает на Анания как на единственный надёжный источник.

Сегодня фамилия остаётся малочисленной. Её носители — потомки тех, кто сохранил в фамилии память о библейском имени, но в той огласовке, которую дала живая речь, а не церковная книга. В этом и заключается её ценность для ономастики: Ананишев — не просто вариант Ананьева, а свидетельство того, как устная традиция перерабатывала книжное имя, превращая его в устойчивый родовой знак.