Фамилия Ананишнева — редкий случай, когда в основе лежит не просто имя, а его обиходная, почти домашняя форма. Она образована от имени Ананишня, которое в свою очередь пошло от канонического Ананий (древнееврейское «Ханания» — «Яхве помиловал»). В русской народной среде имя Ананий переделали на свой лад, добавив суффикс -шн-: так появились ласковые варианты вроде Ананиша, а затем и Ананишня. Суффикс -ев в фамилии указывает на принадлежность: Ананишнева буквально значит «дочь или вдова Ананишни».

Главная особенность этой фамилии — редкость. Она почти не встречается в массовых списках и не попала в распространённые сводки русских фамилий, например, у Б. Унбегауна или В. Никонова. Это говорит о её локальном бытовании. Скорее всего, фамилия закрепилась в одном или нескольких сёлах центральной России или Поволжья, где имя Ананий было популярно в XVI–XVII веках. В отличие от массовых Ананьевых или Ананиных, Ананишнева — результат уникального «двойного» суффикса: сначала уменьшительно-ласкательное -шн- (как в «Маришна» от «Мария»), потом притяжательное -ев.

Мужская форма фамилии — Ананишнев. Носители в прошлом, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми: именно в этих сословиях церковные имена чаще всего переделывали на народный лад. Фамилия не дворянская и не купеческая — её «простота» и редкость указывают на происхождение из среды, где имя передавалось в устной традиции, а не по метрикам. Если ваш предок носил фамилию Ананишнев, он мог быть, например, жителем конкретного села, где это прозвище закрепилось за целым родом.

Сравните с однокоренными вариантами: Ананьев (от полной формы имени), Ананин (от Ананя), Анашкин (от Анашка). Ананишнев стоит особняком — его суффикс -шн- встречается в русских фамилиях редко, чаще в украинских или белорусских (типа Гришнев, Данишнев). Это делает фамилию ценной для историка: она сохранила живую речь прошлого, где имя звучало не по-книжному, а по-домашнему.