Фамилия Ананкина образована от мужского крестильного имени Ананий, которое в переводе с древнееврейского означает «отмеченный милостью Божией». В основу фамилии легла просторечная, уменьшительная форма этого имени — Ананка. Такие формы были характерны для повседневного обихода в крестьянской и мещанской среде, где полное церковное имя часто заменяли более коротким и удобным в быту вариантом. Поэтому, скорее всего, основатель рода Ананкиных принадлежал к простому сословию — крестьянам или посадским людям.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. Фамилия Ананкина буквально означает «дочь (или жена) Ананки». В русской традиции фамилии на -ин сначала закреплялись как притяжательные прилагательные, а затем переходили в разряд наследственных. Интересно, что имя Ананий в народной среде иногда путали с именем Аникий (от греческого «непобедимый»), поэтому не исключено, что часть носителей фамилии Ананкин происходит от того же корня, что и фамилия Аникин. Однако более вероятна прямая связь именно с Ананием, так как форма Ананка — естественное стяжение для русского языка, подобно тому как из Иван получается Ванька, а из Степан — Стенька.

Таким образом, потомок человека по имени Ананка со временем получил фамилию Ананкина. Встречается она преимущественно в центральных и северных регионах России, где имя Ананий было более распространено, чем на юге. Несмотря на кажущуюся редкость, фамилия не уникальна: в современных справочниках можно найти и вариант Ананкин, и однокоренные Ананьев, Анашкин, Анашин.