Фамилия Ананкова — женская форма, образованная от мужской Ананков. В основе лежит разговорная, народная версия канонического имени Иоанн, которое в русском обиходе превратилось в Ивана. У этого имени было множество уменьшительных вариантов: Иванко, Ванек, Ванюта, а в некоторых говорах — Анан и Ананя. От них и появилось прозвище Ананок, где суффикс -ок придаёт ласкательное, уменьшительное значение. Ананок — это буквально «маленький Анан», то есть ребёнок или младший родственник.

Словообразовательная модель проста и прозрачна: к основе «Ананок» прибавили патронимический суффикс -ов, отвечающий на вопрос «чей?» — Ананков сын. А женская форма просто добавила окончание -а. Таким образом, Ананкова означает «принадлежащая Ананку», то есть дочь или жена человека по прозвищу Ананок. Формант -ов характерен для великорусских фамилий и закрепился в центральных и северных губерниях, поэтому корни фамилии логично искать на бывших Владимирской, Костромской или Ярославской землях.

Существует версия о происхождении от тюркского имени Анан (в переводе — «спокойный, надёжный»), но она маловероятна. На Руси фамилии с корнем «Анан-» фиксируются в документах XVI–XVII веков в среде крестьян и посадских людей, а не среди служилых татар. К тому же имя Анан как самостоятельное у русских почти не встречалось, а вот Иван — одно из самых частых крестильных имён, что делает «ивановскую» этимологию естественной и не требующей натяжек.

Сегодня фамилия Ананкова встречается нечасто, но остаётся устойчивой. Её носители живут преимущественно в Центральной России и Поволжье — это подтверждает связь с историческим ареалом распространения отыменных фамилий на -ов. В дореволюционных справочниках Ананковы числились среди крестьян и мещан; дворянского герба за этой фамилией не значится. Зато она сохранила память о том, как в простонародье по-своему переиначивали церковные имена, превращая строгого Иоанна в домашнего Ананка.