Фамилия Андониев образована от имени Андоний, которое представляет собой вариант имени Антоний. В форме Андоний это имя распространено в Молдавии и сопредельных с ней старнах. Мужское имя Антоний, предположительно, связано с греческим словом «anteo», что в переводе на русский язык означает «вступать в бой, состязаться». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Андоний, со временем получил фамилию Андониев.