Фамилия Андоновы (и её мужская форма Андонов) — типичный пример фамилии, образованной от личного имени через притяжательный суффикс -ов. В основе лежит имя Андон, которое представляет собой болгарскую народную форму канонического имени Антон или Антоний. Греческое слово «антос», от которого оно происходит, означает «цветок», а в более широком смысле — «приобретенный взамен» (намёк на древний обычай выкупать или «приобретать» ребёнка у богов).

Имя Антоний получило широкое распространение благодаря христианским святым, в том числе преподобному Антонию Великому (около 251–356 гг.), основателю отшельнического монашества. Однако в тексте упомянут другой сюжет — о рождении святого в 1067 году и бочке с наследством, пущенной в море. Это явная путаница: легенда о бочке относится не к Антонию Великому, а к преподобному Антонию Римлянину (жил в XI–XII веках), который, по преданию, приплыл на камне из Рима в Новгород. Смешение двух житий в народной памяти — характерное явление, но для происхождения фамилии оно не принципиально: имя Антон/Андон было популярно у южных славян независимо от конкретного святого.

Фамилия Андонов — болгарская по происхождению, что подтверждается как языковым материалом (переход «нт» в «нд» в болгарском просторечии), так и документальными записями. В Книге памяти Астраханской области зафиксирован Андон Кочев Андонов, родившийся в 1908 году и живший в Астрахани — вероятно, потомок болгарских переселенцев. Нижегородские списки упоминают Тодора Александровича Андонова (1899 года рождения) из болгарского села Драголово — здесь фамилия прямо указывает на национальность носителя.

Модель образования проста: к основе Андон добавляется суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Андона). Это самый распространённый способ формирования фамилий у болгар, сербов, македонцев и русских. Важно, что в русской среде фамилия Андонов встречается редко и почти всегда указывает на болгарские или македонские корни предка.

Окончательно утверждать, что все носители фамилии происходят из одного места, нельзя. Как и в случае с другими патронимическими фамилиями, Андоновы могли возникнуть независимо в разных регионах — везде, где было распространено имя Андон. Однако именно болгарский след остаётся основным и наиболее документированным.