Основой фамилии Анфиногентова послужило мирское имя Афиноген. В основе фамилии Анфиногентова лежит крестильное имя Афиноген (в переводе с греческого языка – «потомок богини Афины»). Основой же для фамилии послужила его просторечная форма Анфиногент. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Анфиногент, со временем получил фамилию Анфиногентова.