Фамилия Аникей — редкий случай, когда родовое прозвание совпадает с полной формой имени предка, без суффиксов -ов, -ин или -ский. Это так называемая бессуффиксная, или «полуименная», фамилия. В основе лежит крестильное имя Аникей, которое в православных святцах соответствует имени Иоанникий (греч. Ioannikios — «победитель» или «приносящий победу»). В народном произношении имя сильно упростилось: отпало начальное «Ио-», а сложное сочетание «-нник-» стянулось до «-ник-». Получилось Аникей — форма, которая в быту звучала естественнее, чем полный церковный вариант.

Такая модель образования фамилий встречается нечасто. Обычно её давали, когда хотели назвать человека по отцу, но не вводили притяжательный суффикс. Фамилия Аникей могла означать «сын Аникея» или просто закрепиться как уличное прозвище. В документах XVI–XVII веков имя Аникей встречается довольно часто, особенно на Русском Севере и в Поволжье, где архаичные формы держались дольше.

Любопытная деталь: фамилия Аникей может быть и не единственной в своём роду. Если у одного и того же человека в документах писали «Аникей», а у его сына — «Аникеев», то это разные ветви одной семьи. Первая сохранила старую, более редкую форму, вторая пошла по более продуктивной модели с суффиксом. Поэтому носители фамилии Аникей, скорее всего, происходят из тех мест, где фамилии закрепились раньше, чем стала обязательной притяжательная форма на -ов.

С точки зрения социальной истории, Аникей — фамилия недворянская. В списках служилых людей или родословных книгах она не встречается. Её корни — в крестьянской или посадской среде, где имя отца могло стать фамилией без всяких изменений. По сути, это живое свидетельство того, как церковное имя, пройдя через народное произношение, превратилось в родовое прозвание, которое и сегодня звучит так же, как звучало четыреста лет назад.