Фамилия Аниперов — наглядный пример того, как живое произношение переписывает официальное имя. Если произнести её вслух, отбросив «акающий» выговор, сразу слышна основа: греческое имя Онисим или Онисифор. Эти канонические имена, пришедшие на Русь с крещением, в крестьянской и мещанской среде быстро сократили до обиходной формы Анипер (в некоторых говорах — Онипер). Именно от этой усечённой, «домашней» версии и пошла фамилия.

Строение фамилии простое и прозрачное: к основе Анипер добавили стандартный патронимический суффикс -ов. Аниперов буквально означает «сын Анипера». Для этимолога такая модель ценна тем, что она чётко указывает на имя, которое в метрических книгах писали иначе: предка могли записать как Онисима, а в быту звать Анипером — и фамилия закрепилась за народным, а не книжным вариантом. В этом ряду родственных фамилий (Онисимов, Анисимов, Анисифоров, Ониперов) Аниперов стоит особняком: он показывает не просто сокращение, а стяжение, при котором из имени выпал целый слог.

Географически фамилия редкая. Основные очаги её бытования — южнорусские и поволжские области, где «аканье» в речи было особенно сильным и где народные формы имён охотно вытесняли книжные. Встретить Аниперова можно в Воронежской, Тамбовской, Саратовской губерниях, а также у казаков. В дворянских родословных книгах эта фамилия не зафиксирована — её носителями были крестьяне, мещане, однодворцы. Споров вокруг этимологии почти нет: словообразовательная цепочка «Онисим → Анипер → Аниперов» прослеживается по документам XVII–XVIII веков, и никаких других правдоподобных объяснений у фамилии нет.