Фамилия Анисенина — женская форма, а её базовая мужская версия — Анисенин. В основе лежит крестильное имя Онисим (от греческого «онесимос» — полезный), которое в народной речи звучало как Анисим, а отсюда пошли уменьшительные формы вроде Анися или Анисеня. Фамилия образована по продуктивной модели на -ин: Анисеня → Анисенин, то есть «сын или потомок Анисени».

Интересная деталь: написание через «е» в корне (Анис-е-нин) встречается реже, чем вариант Анисинин, и может указывать на местное произношение или запись фамилии «на слух» в документах. В XIX веке, когда фамилии закрепляли за крестьянами и мещанами, писарь нередко фиксировал то, что слышал, поэтому в одной губернии у носителей одного прозвища могли разойтись написания. Анисенина — скорее всего, северный или поволжский вариант: в говорах этих регионов «е» после мягкого согласного перед ударным «и» могло звучать отчётливее.

С точки зрения социальной истории, фамилия Анисенин (и её женская форма) почти наверняка принадлежала крестьянскому или мещанскому сословию. Дворянские роды с таким окончанием редки, а в основе лежит простонародная форма канонического имени, что типично для среды, где имя Онисим было распространено. Сравните с однокоренными Анисимов, Аниськин, Анисенков — все они восходят к одному источнику, но суффикс -ин в Анисенине подчёркивает прямое родство: «чей?» — Анисенин.

По данным переписей и метрических книг, фамилия встречается в основном в центральных и северных областях России — от Ярославской до Вологодской, единично на Урале. За границей практически не фиксируется. Если вы носите фамилию Анисенина, скорее всего, ваши предки жили в деревне, носили имя Онисим в одной из его народных форм и получили фамилию по отцу или деду в середине XIX века, когда паспортизация охватила непривилегированные сословия.