Фамилия Анисенков образована от имени Анис — это не отдельное имя, а производная, уменьшительная форма сразу двух крестильных имён: Онисим и Анисий. Такая двойная основа встречается нечасто и делает разбор фамилии не таким однозначным, как кажется на первый взгляд.

Имя Онисим пришло из греческого языка и означает «полезный». Второй вариант — Анисий — переводится как «исполнение» или «завершение». В быту, в повседневном общении, оба этих имени сокращали до короткого и удобного Анис. Именно от этой обиходной формы и пошла фамилия.

Суффикс -енков указывает на географию происхождения. Такая модель типична для южных и западных регионов России, а также для территории современной Беларуси. Если бы фамилия возникла в центральных или северных областях, она, скорее всего, звучала бы как Анисин или Анисимов. Форма на -енков говорит о том, что предок носителя фамилии жил на землях, где преобладал украинский или белорусский тип образования фамилий, позже адаптированный под русское окончание.

Таким образом, Анисенков — это буквально «сын Аниса». Со временем притяжательное значение стёрлось, и фамилия закрепилась как наследственное родовое имя. Встречаются и однокоренные варианты: Анисенко, Аниськов, Онисенков — все они восходят к тем же именам, но отличаются региональными особенностями произношения и записи.