Фамилия Анисихины отталкивается от имени Анисим, которое пришло на Русь с крещением и в переводе с греческого означало «исполнитель». Но если бы фамилию образовали прямо от канонической формы, мы бы знали Анисимовых. Здесь же сработал другой механизм: за основу взяли не само имя, а обиходное прозвище матери — Анисиха. Так на Русском Севере и в некоторых центральных областях называли женщину, чей муж или отец носил имя Анисим. Это типичная «матронимическая» модель, когда фамилия указывает не на отца, а на мать или хозяйку дома.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Анисихин, то есть сын или потомок Анисихи. Такая модель характерна для фамилий, образованных от слов женского рода на -а/-я, и встречается реже, чем патронимические (-ов/-ев). В ономастике это ценный маркер: фамилии типа Анисихины, Марьины, Татьянины говорят о том, что в крестьянской среде женщина могла быть главой семьи или её имя закреплялось в быту прочнее мужского.

Географически фамилия тяготеет к северным и северо-восточным регионам России — Архангельской, Вологодской, Вятской губерниям. Там матронимические фамилии держались дольше, чем в центральных областях, где раньше восторжествовала стандартная модель «от отчества». Встречается и вариант написания через «е» — Анисехины, но он редок и связан с местным произношением.

О точном времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс закрепления наследственных прозвищ шёл несколько столетий, и Анисихины могли оформиться как фамилия в XVII–XIX веках. Ясно одно: фамилия эта не книжная, не дворянская — она вышла из живой народной речи, где Анисихой звали реальную женщину, чьё имя и осталось в роду.