Основой фамилии Анискина послужило церковное имя Аниска. Анисий — это фонетический вариант крестильного мужского имени Онисим, появившийся в результате влияния «акающих» говоров. Само же имя имеет греческое происхождение и переводится на русский язык как «полезный». С течением времени имя Анисий стало употребляться как самостоятельное со значением «исполнение, завершение». В основу фамилии легла его просторечная форма Аниска. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Аниска, со временем получил фамилию Анискина.