Фамилия Аниськов, при беглом взгляде, кажется простой, но на деле ставит перед исследователем дилемму: от какого именно имени она произошла? В основе почти наверняка лежит разговорная форма крестильного имени. Вопрос только в том, какая.

Самая распространённая версия отталкивается от имени Онисим (с греческого — «полезный»). В быту это имя сокращали до Ониська или Аниська. Фамилия, образованная от этой усечённой формы по стандартной для русских фамилий модели (суффикс -ов, означающий принадлежность), дала бы Аниськов. То есть Аниськов — это «сын Аниськи», а Аниська — домашнее прозвище Онисима.

Однако существует и вторая, не менее убедительная гипотеза. Она ведет родословную к имени Анисий (в переводе с греческого — «исполнение» или «завершение»). Его уменьшительная форма звучала так же — Аниська. Таким образом, фамилия могла возникнуть параллельно, от двух разных источников, просто совпавших в звучании.

Оба имени — Онисим и Анисий — были распространены в крестьянской и мещанской среде. Поэтому однозначно определить, какой из них стал основой для конкретной ветви Аниськовых, без генеалогических изысканий невозможно. Важно, что в любом случае фамилия указывает на прямого предка-носителя одного из этих имён.

Сама модель образования — от уличного, бытового, а не полного церковного имени — характерна для фамилий, которые складывались в XVI–XVII веках, чаще всего у простых сословий. Аниськовы не принадлежали к аристократии: фамилии знати чаще образовывались от полных форм имён или прозвищ.

В написании фамилии обращает на себя внимание буква «к» в суффиксе. Она идёт не от имени Анисий, а именно от уменьшительной формы Аниська. Если бы фамилия образовалась напрямую от Анисия, мы бы, скорее всего, имели вариант Анисьев или Анисин. Форма Аниськов — более «народная», просторечная, что ещё раз подтверждает её происхождение из среды, где имена не церемонно переделывали на свой лад.