Фамилия Анистишена — редкая и неочевидная. Её основа и суффикс сразу вызывают вопросы, потому что привычное для русских фамилий окончание -ов/-ев здесь отсутствует. Вместо этого мы видим финаль -ена, что наводит на две версии: либо это женская форма фамилии (обычно от мужской на -ен, как Петрен — Петрена), либо перед нами фамилия, образованная через суффикс -ин, но с чередованием, которое изменило звучание. Второй вариант маловероятен: суффикс -ин даёт окончание -ин, а не -ен. Поэтому логичнее предположить, что Анистишена — это форма, закрепившаяся за женщиной или перешедшая в неизменяемый вариант по аналогии.

Корень фамилии — «Анистиш» — звучит инородно для русского уха. Скорее всего, это искажённая или адаптированная на русской почве фамилия неславянского происхождения. Можно предположить, что в основе лежит греческое имя Анистис (Ανίστης) или его вариант Анист. Греческие фамилии на -ис, -ос при переселении в Россию нередко обрастали русскими суффиксами или меняли окончание. В таком случае Анистишена могла возникнуть от прозвища или отчества Анистиш — как «сын Анистиса», а затем фамилия закрепилась в женском роде.

Есть и другая, более прозаичная версия: фамилия могла возникнуть от топонима или названия населённого пункта. В западных регионах бывшей Российской империи (Беларусь, Украина, Польша) встречаются названия вроде Анистишки, Анистово. Переселенцы из таких мест могли получить фамилию по месту выхода, а суффикс -ен- характерен для белорусских и польских фамильных моделей (сравните: Коваленя, Стасеня). В этом случае Анистишена — это «та, что из Анистишек».

Точных данных о распространении фамилии мало. В современных базах она встречается единично, что подтверждает её редкость. Сословной принадлежности предков по одной фамилии не определить: носителями могли быть и крестьяне, и мещане, и духовенство — всё зависит от конкретной семьи. Главное, что ясно: перед нами не случайная описка, а фамилия с нестандартной словообразовательной историей, скорее всего, связанная с греческим или западным корнем и адаптированная русским языком.