Фамилия Анисюткина — женская форма фамилии Анисюткин, которая образована от имени или прозвища Анисютка. В основе лежит просторечная форма канонического имени Онисим (от греческого «онисимос» — полезный, благотворный). В русской народной традиции имя Онисим преобразовалось в множество уменьшительных вариантов: Ониска, Аниска, Анисимка, а также Анисютка. Суффикс -ютк- в этом случае — редкий и характерный для северных и северо-восточных говоров (например, в вятских, архангельских диалектах), где с помощью -ютк- образовывали ласкательные формы имён. Так Анисютка буквально означает «маленький Онисим».

Суффикс -ин в фамилии Анисюткин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Анисютки, то есть потомок человека, которого в быту звали Анисюткой. Такая модель типична для русских фамилий, но интересно, что здесь основа не на -а/-я (как в фамилиях типа Ильин), а на -к-, что делает её более разговорной и «деревенской» по звучанию. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от полных имён, Анисюткин — пример фамилии, возникшей в крестьянской среде, где людей чаще называли уменьшительными именами.

Географически фамилия Анисюткин (и Анисюткина) тяготеет к регионам Русского Севера и Вятки. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: скорее всего, предки носителей фамилии жили в одной местности, и фамилия закрепилась за одним родом. В дореволюционных переписях такие фамилии могли фиксироваться с разными окончаниями (Анисюткин, Анисюткина, даже Анисютков), но форма на -ин оказалась устойчивее.

Редкость фамилии — не недостаток, а её особенность. Если вы носитель фамилии Анисюткина, то, вероятно, ваши предки были крестьянами или ремесленниками из северных губерний, а само имя Онисим в роду передавалось как минимум в двух поколениях, пока не превратилось в родовое прозвище.