Фамилия Ануфрей — редкий случай, когда в основе лежит не прозвище и не профессия, а полная форма старинного канонического имени, которое в народе почти всегда сокращали. Это имя — Онуфрий, а точнее, его просторечный вариант Ануфрий. В святцах имя звучало как Онуфрий, но в быту на Руси начальное «о» часто переходило в «а» (как в словах «акать», «Алексей» из «Олексей»). Так Онуфрий превратился в Ануфрия, а фамилия от него — в Ануфрей.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Обычно от имени Ануфрий образовывали фамилию Ануфриев — через притяжательный суффикс «-ев» (чей? — Ануфриев сын). Но форма Ануфрей застыла без суффикса, то есть сама фамилия совпала с разговорным вариантом имени. Это так называемая «патронимическая фамилия в нулевой форме», когда имя отца стало родовым прозвищем без добавления типовых окончаний. Такие фамилии редки и обычно указывают на очень раннее закрепление прозвища за родом, еще до того, как в XVI–XVII веках массово вошли в обиход фамилии на «-ов» и «-ин».

Само имя Онуфрий (Ануфрий) имеет древнеегипетские корни через греческое посредство и означает «священный бык» или «благой». На Руси оно ассоциировалось прежде всего с преподобным Онуфрием Великим, пустынножителем IV века, поэтому имя давали в монашеской среде и среди крестьян, почитавших этого святого. Носитель фамилии Ануфрей, скорее всего, происходил из семьи, где отца или деда звали Ануфрием, причем это имя употреблялось как полное, без уменьшительных форм, что само по себе говорит о консервативном укладе.

Географически фамилия Ануфрей тяготеет к южнорусским и белорусским областям, где «аканье» в именах было особенно сильным, а также к старообрядческим общинам, где сохранялись архаичные формы имен. Встречается она редко, и это делает её ценным маркером для генеалогического поиска: если вы носите фамилию Ануфрей, то, скорее всего, ваш предок был записан в документах не по отчеству, а по имени собственному, что характерно для однодворцев или казачьих родов, где фамилии складывались стихийно.

Изредка фамилию путают с Ануфриевым, считая её просто усеченным вариантом, но это ошибка. Разные суффиксы указывают на разную историю: Ануфриев — это «сын Ануфрия», а Ануфрей — это «сам Ануфрий», то есть родоначальник, чьё имя стало фамилией без изменений. Такая форма встречается и у других редких фамилий вроде Иван, Петр, Фома, но для имени Ануфрий она особенно показательна.