Фамилия Ануфриев образована от канонического имени Онуфрий, которое пришло на Русь вместе с христианством. В переводе с древнееврейского оно означает «священный бык» — редкий случай, когда имя прямо отсылает к культовому животному. Чередование гласных о/а в корне объясняется влиянием «аканья»: в южнорусских и среднерусских говорах безударное «о» произносили как «а», и имя Онуфрий в бытовой речи превратилось в Ануфрий. Так появилась форма, закрепившаяся в фамилии.

В основе фамилии лежит не само имя, а его просторечный вариант — Ануфрий. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Ануфриев буквально значит «сын Ануфрия» или «потомок Ануфрия». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на -ий: замена окончания на -ев давала притяжательное прилагательное, которое затем застыло в родовом прозвании.

Стоит различать Ануфриева и Онуфриева. Обе фамилии восходят к одному источнику, но закрепились в разных диалектных зонах. Онуфриев — более старая, церковная форма, а Ануфриев — народная, «акающая». В документах XVII–XVIII веков встречаются обе записи, иногда даже у одной семьи: писцы могли записать крестьянина по-разному в зависимости от своего произношения.

Среди возможных предков — крестьяне, посадские люди или служилые. Имя Онуфрий было распространено во всех сословиях, но фамилия Ануфриев чаще встречается в среде, где преобладало устное, а не книжное произношение. Географически она особенно частотна в южных и центральных областях России — там, где аканье было нормой.

В современных справочниках фамилия не редкая. По данным переписей, Ануфриевы живут по всей России, но заметное число носителей сосредоточено в Курской, Белгородской и Воронежской областях. Встречается и украинский вариант — Ануфрієв, с тем же корнем, но другой графикой.