Фамилия Ануфриева образована от имени Онуфрий, которое в переводе с древнееврейского означает «священный бык». Чередование гласных о/а в начале фамилии — результат влияния «аканья», то есть произносительной нормы, свойственной южнорусским и среднерусским говорам, где безударное «о» переходит в «а». Так потомок человека по имени Онуфрий со временем получил фамилию Ануфриева.

По словообразовательной модели это типичная «патронимическая» фамилия на -ев, указывающая на принадлежность к роду: Ануфриев сын, то есть сын Ануфрия. Суффикс -ев присоединяется к основам на мягкий согласный или на -й, что и произошло с именем Ануфрий (разговорная форма церковного Онуфрий). Само имя Онуфрий в святцах связано с преподобным Онуфрием Великим, египетским пустынником IV века, поэтому фамилия имеет православные корни и встречается преимущественно в русской, украинской и белорусской среде.

В отличие от многих фамилий, образованных от распространённых имён, Ануфриева сохранила яркий признак акающего произношения, что делает её ценной для диалектологов. Географически фамилия чаще фиксируется в южных областях России — например, в Курской, Воронежской, Ростовской областях, где аканье исторически преобладало. В северных и сибирских регионах, где сохранялось оканье, предпочтительнее форма Онуфриева.

Спорных версий происхождения у этой фамилии нет: основа прозрачна, а чередование гласных имеет убедительное фонетическое объяснение. Редкие варианты написания вроде Анофриев или Анофреев связаны с дальнейшим упрощением в народной речи, но именно форма Ануфриева закрепилась в официальных документах и метриках.