Фамилия Апанасенко — один из ярких примеров южнорусской и украинской модели образования фамилий. Её основа — просторечная форма имени Афанасий, которое в народной среде звучало как Апанас (с характерной заменой начального «аф» на «ап»). Само имя Афанасий восходит к греческому «атанасиа», что значит «бессмертие». В старину это имя было широко распространено среди простых людей, а его покровителями считаются Святой Афанасий Александрийский и Святой Афанасий Афонский.

Суффикс -енко в этой фамилии — типичный для украинского ономастикона. Он указывал на родство: Апанасенко буквально понималось как «сын Апанасия» или «потомок Апанаса». Такая модель была особенно популярна в Левобережной Украине, на Слобожанщине и в южных регионах Российской империи, где фамилии на -енко со временем закрепились как наследственные.

Интересно, что фамилия Апанасенко сохранила живую народную фонетику: в официальных документах имя Афанасий часто записывалось по церковному канону, а в быту люди называли друг друга Апанасами. Эта двойственность породила целое гнездо однокоренных фамилий — Апанасов, Апанасенков, Панасенко, Панасюк. Все они отталкиваются от одной и той же просторечной основы, но различаются по суффиксам, привязанным к разным территориям.

Социально предки Апанасенко, скорее всего, относились к крестьянскому или казачьему сословию. Фамилия не носит дворянского или книжного оттенка — она бытовала в среде, где имя Афанасий было привычным и частым. Географически фамилия до сих пор плотнее всего встречается в Украине, особенно в Черкасской, Полтавской и Сумской областях, а также в приграничных регионах России.