Фамилия Апарцина — женская форма, а её мужской вариант, Апарцин, встречается крайне редко. В основе фамилии лежит прозвище или неканоническое имя Апарца, которое, скорее всего, восходит к диалектному глаголу «апарить» — то есть обдать паром, ошпарить. В южнорусских и украинских говорах это слово могло относиться к человеку вспыльчивому, «горячему», либо, наоборот, к тому, кто занимался ошпариванием — например, при обработке дерева, кожевенном деле или при заготовке кормов. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Апарцин — «сын Апарцы» или «человек из семьи Апарцы».

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с греческим именем Апарций (от слова «апарх» — начальник, правитель), которое могло попасть в русскую среду через церковные или торговые контакты. Однако для крестьянской и мещанской среды, где чаще всего и возникали фамилии с суффиксом -ин, прозвищное происхождение от бытового слова гораздо правдоподобнее.

Географически фамилия Апарцина тяготеет к югу России и востоку Украины, где диалектная форма «апарить» была в ходу. В дореволюционных переписях она встречается в Воронежской и Курской губерниях, а также среди казачьего населения Дона. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — потомками служилых людей, осевших на южных рубежах.

Интересно, что фамилия не имеет ни одной распространённой однокоренной параллели вроде Апаров или Апарин — это делает Апарцину довольно изолированной в словообразовательном гнезде. Единственное близкое по звучанию — фамилия Опарцин, но там основа связана с «опарой» (тестом), что указывает на другое ремесло. Таким образом, Апарцина — редкий пример фамилии, образованной от узкого диалектного глагола, который не превратился в массовую модель.