Фамилия Апатин, вероятно, происходит от имени Апатя, которое является просторечной формой крестильного имени Ипатий. В переводе с греческого оно означает «высочайший». Таким образом, потомок человека, которого звали Апатя, со временем получил фамилию Апатин.