Фамилия Апатины образована от личного имени предка. В её основе лежит имя Апатя — просторечная, обиходная форма крестильного имени Ипатий. Имя Ипатий пришло на Русь вместе с христианством из греческого языка, где ὑπατος означает «высочайший», «консул» — в античном мире так называли высшее должностное лицо. Таким образом, буквальное значение фамилии — «потомок Апати», то есть человека, которого в быту звали уменьшительно Апатя.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?») и характерен для фамилий, образованных от основ на -а/-я. По этой же схеме построены фамилии Апатов, Апатьев, а также более редкие Апатины — вариант с тем же корнем, но другим суффиксальным оформлением. Интересно, что имя Ипатий в народной речи дало целый ряд производных: Ипат, Ипатий, Ипатьев, Патя, Апатя — и все они оставили след в русском ономастиконе.

Фамилия Апатины встречается в нескольких регионах, но наиболее плотно — в центральных и северных областях России, где имя Ипатий было в ходу среди крестьян и мещан. В святцах поминается несколько святых с этим именем, что поддерживало его популярность вплоть до XIX века.

Безусловно, фамилия Апатины — памятник славянской культуры, запечатлевший живой процесс адаптации церковного имени в народной среде. Однако окончательно говорить о точном времени и месте её возникновения можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований: формирование каждой отдельной фамилии могло быть длительным и не всегда привязано к одной местности.