Фамилия Апатов происходит от имени Апат, которое является просторечной формой крестильного имени Ипатий. В переводе с греческого оно означает «высочайший». По другой версии, фамилия Апатов имеет еврейское происхождение и ведет свое начало от аналогичного прозвища. В его основе лежит топоним Опатов (Апт на идиш) – такое название носит город в Свентокшиском воеводстве Польши. Соответственно, предок Апатовых мог быть уроженцем Опатова. Таким образом, потомок человека, которого звали Апат, со временем получил фамилию Апатов.