Фамилия Апатина, вероятно, происходит от имени Апатя, которое является просторечной формой крестильного имени Ипатий. В переводе с греческого оно означает «высочайший». Скорее всего, основатель рода Апатиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, которого звали Апатя, со временем получил фамилию Апатина.