Фамилия Апёнкин (встречается также вариант Опёнкин) образована от прозвища Апёнка. В его основе — название грибов опят. Слово «опёнок» буквально значит «растущий около пня», «на пне»: опята селятся на отмершей древесине и пнях. Прозвище Апёнка могли дать человеку, который жил в местности, богатой этими грибами, или был их большим любителем и сборщиком. Фамилия построена по простой и распространённой модели: к основе Апёнк- прибавлен патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Апёнки). Со временем потомки человека с таким прозвищем закрепили за собой фамилию Апёнкины. Написание через «а» в первом слоге (Апёнкин) — результат типичного для русских говоров аканья, когда безударное «о» произносится и закрепляется на письме как «а». Таким образом, оба варианта, Апёнкин и Опёнкин, однокоренные и восходят к одному и тому же прозвищу.