Фамилия Аполитова — женская форма фамилии Аполитов, и её происхождение напрямую связано с тем, как в русской народной традиции «обкатывали» длинные греческие имена. Основа здесь — имя Апполинарий, означающее «посвящённый Аполлону». В крестьянской среде полное имя было громоздким, поэтому его сокращали до обиходных форм — Аполит или Аполина. Именно от такой упрощённой формы и пошла фамилия.

Модель образования типична и прозрачна: к основе «Аполит» добавили патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — «сын Аполита»). Важно, что написание с одной «п» — не ошибка, а точное отражение живого произношения. В церковных записях имя Апполинарий могли фиксировать по-разному, но фамилия закрепилась в той фонетической форме, которая была привычна в данной местности. Есть и однокоренные варианты — Аполитов, Аполинаров, Апполитов (с двойной «п»), но Аполитова — один из самых «обкатанных» в быту вариантов.

В отличие от фамилий, образованных от прозвищ или названий ремёсел, Аполитова — «календарная» фамилия, то есть произошедшая от крестильного имени. Это значит, что её носители — потомки человека, которого в быту звали Аполит. Сословная принадлежность предков могла быть любой, но в дворянской среде такие упрощённые формы встречались реже: там предпочитали полные варианты вроде Апполинариев. Скорее всего, предки были крестьянами или мещанами.

Географически фамилия не привязана к одному региону, но чаще встречается в областях с влиянием южнорусских говоров, для которых характерно «аканье» и упрощение групп согласных.