Фамилия Аполлнов — редкий случай, когда основа происходит от имени собственного, но не от крестильного, а от мифологического. В основе лежит имя Аполлон — древнегреческого бога искусств, света и покровителя муз. В русскую культуру это имя вошло через православные святцы, но никогда не было особенно распространённым. Соответственно, и фамилия, образованная от него, встречается нечасто.

Суффикс -ов указывает на стандартную патронимическую модель: Аполлнов буквально означает «сын Аполлона». Отчество Аполлонович в старину давалось человеку, чьего отца звали Аполлоном. Такое имя мог получить мальчик в семье, где родители хотели подчеркнуть образованность, тягу к прекрасному или просто следовали моде на античные имена, которая была сильна в дворянской и купеческой среде XVIII–XIX веков.

Интересная особенность — написание фамилии. В ней две «л» (Аполлнов), хотя в самом имени Аполлон пишется с двумя «л», а в производных фамилиях часто встречается вариант с одной «л» — Аполонов. Двойное «л» сохраняет исходную графику имени, и такая орфография встречается реже. Вероятно, предки носителя фамилии были грамотными людьми, которые фиксировали написание по церковным книгам, где имя писалось через две «л».

По происхождению Аполлновы — это не крестьянская и не однодворческая фамилия. В среде крепостных крестьян имена Аполлон давали редко, скорее это городское или духовное сословие. В семинарской среде такие имена давали в честь античных богов, чтобы подчеркнуть учёность. Поэтому среди возможных предков — священники, дьячки, либо купцы и мещане, которые хотели выделить ребёнка необычным именем.

Географически фамилия не привязана к какому-то одному региону. По данным переписей, Аполлновы встречаются разрозненно: в центральных губерниях, на Урале, в Сибири, но везде единично. Это подтверждает, что фамилия не образовалась в большом коллективе (например, в крестьянской общине), а возникала в отдельных семьях независимо.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Аполонов, Аполлонов, Аполлонский — показывает, что форма Аполлнов самая лаконичная и редкая. Она обходится без лишнего суффикса -ов- (как в Аполлонов) и без книжного окончания -ский. Это указывает на более простое, бытовое происхождение: не от фамилии, данной в духовном училище, а от прямого отчества.