Фамилия Аполонская — женская форма от Аполонский, и её разбор стоит начать именно с суффикса. Окончание -ский (в женском роде -ская) выдает типичную польскую или западнорусскую модель образования. В прошлом такие фамилии часто указывали на шляхту или духовенство, но в XIX веке их активно перенимали и мещане, и крестьяне, особенно на землях бывшей Речи Посполитой. Суффикс -ский, в отличие от простых -ов/-ин, изначально подчеркивал связь с местом или родом.

Основа фамилии — Аполон. Это народная, разговорная форма имени Аполлон, которое в России встречалось нечасто, но прочно обосновалось в среде духовенства. Семинаристы и священники нередко получали фамилии от имен античных богов или святых — так появлялись Аполлонские, Аполлосовы, Аполлинариевы. Однако есть и другая, «географическая» версия: фамилия могла возникнуть от названия села или хутора Аполоново, Аполонь (такие топонимы встречаются на Украине и в Беларуси). Тогда предки были не просто носителями имени, а выходцами из конкретного места.

Менее известная, но любопытная версия отсылает к диалекту: в некоторых говорах «аполон» — искаженное «ополонь», то есть пойменный луг, заливное место. В этом случае фамилия могла означать «живущий у заливного луга». Но это редкое слово, и связь с именем Аполлон все же надежнее: в метрических книгах XVIII–XIX веков форма «Аполон» фиксируется как обиходный вариант церковного имени.

Социальный статус первых носителей, скорее всего, был связан либо с церковной средой (семинарская фамилия), либо с мелкими дворянами или однодворцами, получившими фамилию по месту жительства. Искать корни Аполонских стоит в юго-западных губерниях Российской империи — на Волыни, Подолье, в Киевской губернии. В современной России фамилия редкая, но не исчезнувшая.