Фамилия Аполонский — редкий случай, когда церковное имя перешло в фамилию не через привычные суффиксы -ов или -ин, а через польскую или украинскую модель на -ский. Основа здесь — имя Аполлон, которое в православных святцах носил один из семидесяти апостолов, ученик апостола Павла. В крестьянской среде имя было нечастым, но встречалось, особенно в семьях, где ценили книжное или «благородное» звучание.

Фамилия образована по типу «от имени отца + суффикс принадлежности». Если бы предка звали Аполлон, его сын мог стать Аполлоновым. Но суффикс -ский указывает на иную традицию: чаще всего так образовывали фамилии в шляхетской среде Речи Посполитой или у духовенства, где к основе добавляли -ский/-цкий для придания «дворянского» оттенка. В русском контексте Аполонский мог возникнуть в семинариях: будущих священников нередко наделяли фамилиями по именам античных богов или святых, и Аполлонский (с двумя «л») превращался в Аполонский при записи.

Обратите внимание на написание: фамилия пишется через одно «л», хотя имя-первоисточник — с двумя. Это типичная народная или канцелярская упрощённая форма. В XIX веке встречался вариант Аполлонский, но он почти исчез. Географически фамилия тяготеет к юго-западу России и Украине: в переписях XIX века носители фиксировались в Подольской, Волынской губерниях и в областях, входивших в Речь Посполитую.

Версия о происхождении от прозвища Аполон (так могли назвать красивого или статного мужчину) менее вероятна: такие прозвища в народе давали редко, предпочитая более бытовые черты. Скорее всего, предок носителя фамилии был либо священником, получившим «красивое» семинарское имя, либо выходцем из мелкой шляхты, где фамилии на -ский были нормой.