Фамилия Апполонова образована от мужского имени Аполлоний, которое имеет греческие корни и переводится как «губительный». В основе фамилии лежит не полная, а просторечная форма этого имени — Апполон, которая была распространена в русской бытовой среде. Суффикс -ов указывает на принадлежность: первоначально Апполонова означало «дочь (или жена) Апполона», а в более широком смысле — потомок человека по имени Апполон.

Имя Аполлоний восходит к имени древнегреческого бога Аполлона, покровителя искусств и света. Однако его значение «губительный» связано с другой ипостасью божества — карающего стрелами и насылающего мор. В христианской традиции это имя также носило несколько ранних святых, поэтому оно попало в святцы и использовалось при крещении. В народе церковное имя Аполлоний часто упрощали до более привычного Апполон — отсюда и возникла основа фамилии.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ов присоединялся к основе имени или прозвища, оканчивающейся на твёрдый согласный. В данном случае основа Апполон- дала фамилию Апполонов, а женская форма Апполонова закрепилась за женщинами или детьми по отцу. Стоит отметить, что написание с двумя «п» в корне — особенность русской адаптации греческого имени: в оригинале Ἀπολλώνιος пишется с одной «п» после «о», но в славянской традиции удвоение стало нормой.

Географически фамилия Апполонова не привязана к одному региону — она встречается в разных областях России, но везде довольно редка. Это объясняется невысокой частотностью самого имени Аполлоний в крестьянской среде: оно чаще бытовало среди духовенства и городских сословий. Поэтому носители фамилии могли происходить из семей, где предок был либо священнослужителем, либо человеком, получившим имя по святцам в честь малоизвестного святого.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Аполлонов (с одной «п») встречается ещё реже и фиксируется в основном у потомков тех, кто сохранял книжное написание имени. Форма Апполонова, напротив, отражает живое произношение и более древнюю традицию передачи имени в устной речи. Таким образом, фамилия — не просто калька с греческого, а свидетельство того, как церковное имя адаптировалось в повседневном русском языке.