Фамилия Апполонский — одна из тех, в которых слышна история, но не всегда очевидна прямая дорога к прозвищу или профессии. На слух она кажется «иностранной» или книжной, и это ощущение не обманывает. Её основа — имя Аполлон (через удвоенное «п» в русской традиции XIX века, когда фамилия и фиксировалась). Но из трёх версий происхождения серьёзную проверку выдерживает только одна.

Самая надёжная версия — семинарская. Фамилии на -ский с «античным» или церковным корнем в массе своей появлялись в духовных училищах и семинариях. Священникам и их детям давали «красивые» фамилии по именам святых: в православии почитается святой мученик Аполлон, так что античный бог здесь ни при чём. Выпускник мог получить фамилию Аполлонский (или Апполонский) при поступлении или окончании семинарии — суффикс -ский был в этой среде типичным маркером искусственного, «учёного» образования, в отличие от бытовых фамилий крестьян или мещан.

Вторая версия — происхождение от мирского прозвища или некалендарного имени Аполлон. В крестьянской среде до XIX века могли назвать ребёнка редким именем — из любви к античности или просто по созвучию. Тогда Апполонский формально значило бы «сын Аполлона», но добавление суффикса -ский для крестьянской фамилии нетипично: обычно в таком случае появилось бы Аполлонов или Аполлонин. Поэтому эта гипотеза слабее.

Третий вариант — географический. Теоретически фамилия могла образоваться от названия населённого пункта вроде Аполлоновка или Аполлонское. Такие топонимы, связанные с помещичьими усадьбами, названными в честь владельца Аполлона, встречаются на юге России и в Украине. Однако массовых, известных сёл с таким названием нет, и эта гипотеза остаётся умозрительной.

Главная особенность фамилии — написание с двумя «п». В дореволюционной орфографии имя Аполлон писали с одной «л», но с двумя «п» (через греческое διπλοῦν). Фамилия закрепилась именно в таком, «учёном» варианте, что дополнительно указывает на книжное, а не народное происхождение. Таким образом, с высокой вероятностью предок носителя фамилии Апполонский был либо семинаристом, либо священником, получившим фамилию по святцу, либо, реже, выходцем из духовного сословия, где такие «красивые» фамилии были нормой.