Основой фамилии Апракин послужило церковное имя Апрака. Фамилия Апракин образована от имени Апрака, которое, вероятно, является народной формой крестильного женского имени Апраксия (Евпраксия), что в переводе с греческого на русский язык означает «благотворительница». Покровительницами имени являются преподобная Евпраксия, дева Тавенская и благоверная княгиня Евпраксия Псковская, в миру Евфросиния. Менее вероятно, что имя Апрака является производной формой татарского имени Аппак, которое в переводе на русский означает «чистый, непорочный». Вероятно, нарекая ребенка таким именем как Апрак, родители хотели, чтобы в будущем их сын стал достойным мусульманином. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Апрака, со временем получил фамилию Апракин.