Фамилия Аристарин — редкий пример, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с греческим языком, но не напрямую с именем Аристарх, как можно было бы подумать. Корень здесь — «аристар» или «аристар(ос)», что в древнегреческом означает «лучший начальник», «лучший вождь». Однако фамилию образовали не от полного имени, а от его сокращённой, разговорной формы — Аристара. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Аристарин, то есть сын или потомок Аристары.

Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин широко распространены. В южных и восточных регионах скорее встретился бы вариант Аристаров. Сама фамилия встречается крайне редко, и её география тяготеет к старым торговым путям, где оседали выходцы из греческого или южнославянского духовенства. В XVII–XVIII веках греческие имена часто давали детям в среде приказных людей и мелких священнослужителей, подражавших византийской образованности.

В отличие от фамилии Аристархов, которая прямо отсылает к полному каноническому имени, Аристарин — более бытовая, «домашняя» форма. Прозвище Аристара мог получить не только грамотей или начальник, но и человек с властным, требовательным характером: «аристар» в народном сознании ассоциировалось с чем-то отборным, первым. Иногда так называли и старшего сына в семье, первого помощника отцу.

Написание фамилии устойчиво, без вариантов через «о» или «е». Двойное «р» в корне — признак книжного, неискажённого произношения: в просторечии фамилия могла бы звучать как Астарин или Астаров, но грамотные переписчики сохранили начальную форму. Встречаются единичные носители в Рязанской и Тверской областях, что косвенно подтверждает связь с церковной или купеческой средой — именно там ценили «учёные» имена.