Фамилия Арония — редкая, и её происхождение не укладывается в одну простую схему. Скорее всего, перед нами не русская, а искусственная или книжная фамилия, образованная от греческого корня. В основе лежит слово «арон» (Ἄρων) — так в греческой мифологии звали одного из сыновей Посейдона, или же библейское имя Аарон (в греческой передаче — Аарон, Ἀαρών). Однако суффикс -ия нетипичен для русских фамилий: он встречается в латинизированных или семинарских фамилиях, которые давали выпускникам духовных училищ. В XIX веке священники и семинаристы нередко получали звучные фамилии на -ий, -ия, -ей — например, Адонис, Афинский, Кипарисов. Арония могла появиться как «красивая» грецизированная форма, отсылающая либо к имени Аарон, либо к растению арония (черноплодная рябина), которое, впрочем, стало известно в ботанике позже, в XIX–XX веках.

Вторая версия, менее вероятная, — географическая. Фамилия могла возникнуть у выходцев из местечка или села с похожим названием (например, Арония в Греции или на Балканах). Но для русской среды это нетипично: фамилии на -ия почти всегда книжные, а не оттопонимические.

Словообразовательная модель проста: основа «Арон» + окончание -ия, которое выполняет роль суффиксального элемента, превращая имя в фамилию. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Аро́ния. Встречается фамилия крайне редко, преимущественно в среде потомков духовенства или в семьях с греческими корнями. В современной России её носителей единицы, и точных исторических записей о сословной принадлежности нет — можно лишь предполагать, что предки были либо священнослужителями, либо людьми, получившими фамилию в семинарии.