Фамилия Арутюняан — это, скорее всего, нестандартная передача на русский язык армянской фамилии Арутюнян. Двойное «а» в конце (Арутюняан) — не опечатка, а редкое, но встречающееся написание, которое могло закрепиться при паспортизации из-за особенностей произношения или слухового восприятия. В самой Армении такая форма нехарактерна.

Основа фамилии — армянское мужское имя Арутюн (арм. Հարություն), что значит «воскресение». Это церковное имя, связанное с праздником Пасхи. В армянской ономастике оно столь же распространено, как в русской имя Воскресенский, но используется как личное, а не фамильное прозвище.

Суффикс «-ян» (или «-ан» в некоторых диалектах) — классический армянский патронимический формант, указывающий на принадлежность к роду. Арутюнян, таким образом, означает «из рода Арутюна», «потомок Арутюна». В русской записи суффикс часто упрощается до «-ян», но в редких случаях, как в вашем примере, гласная удваивается, что может быть следствием влияния литературной нормы или местного говора.

Если отталкиваться от географии, фамилии с таким написанием чаще встречаются у армян, долго живших в России или бывших республиках СССР, где паспортисты могли исказить оригинальное окончание. В самой Армении вы почти не найдёте носителей с двойным «а» — там форма строго Арутюнян.

Сравните с однокоренными армянскими фамилиями: Арутюнян, Арутюнов (русифицированная форма с суффиксом «-ов»), реже Арутюнянц. Ваш вариант — Арутюняан — стоит особняком как графический курьёз, который, однако, не меняет смысла: предок носителя был человеком по имени Арутюн, и фамилия прочно привязана к христианской традиции Армении.