Фамилия Атишев — редкий случай, когда корень слова почти не требует расшифровки для носителя тюркских или иранских языков. Основа здесь — «атиш», что в персидском означает «огонь». Прозвище Атиш могли дать человеку с ярко-рыжими волосами, которые ассоциировались с пламенем. Вторая версия — отсылка к характеру: горячий, вспыльчивый, несдержанный в гневе. Такие прозвища на Руси давали метко и без злого умысла, просто фиксировали заметную черту.

Менее очевидный, но правдоподобный вариант — профессиональная принадлежность. Артиллеристов в XVIII–XIX веках в просторечии называли «огненными людьми» или «пушкарями», и прозвище Атиш могло закрепиться за тем, кто служил при орудиях. В пользу этой версии говорит тот факт, что фамилии, образованные от названий военных специальностей (Пушкарёв, Стрельцов), встречаются часто, а Атишев мог стать их иноязычным аналогом.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Атишев — сын Атиша. Модель образования типична для русских фамилий, но сама основа явно восточного происхождения. Географически фамилия тяготеет к Поволжью и южным регионам, где исторически сильны тюркско-персидские языковые контакты. Встречается она нечасто, что делает её ценной для локальной ономастики: по ней можно проследить миграцию носителей прозвища из зоны культурного пограничья вглубь русских земель.

Споров вокруг этимологии почти нет: персидский корень «атеш» (огонь) зафиксирован в словарях, альтернативные версии вроде связи с тюркским «ат» (лошадь) или арабским «атиш» (жажда) лингвистически слабее — в них не объясняется суффиксальная модель фамилии.