Фамилия Авакимов образована от имени Аваким, которое является просторечной формой крестильного имени Аввакум. Оно имеет древнееврейское происхождение и переводится на русский язык как «обнимающий». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Аваким, со временем получил фамилию Авакимов.