Фамилия Бабушин образована по редкой для русских фамилий модели — с суффиксом -ин от прозвища или имени, оканчивающегося на -уша. В данном случае основа — «Бабуша». Такая словообразовательная схема характерна скорее для западнорусских и белорусских земель, где фамилии на -ин нередко возникали от прозвищ с уменьшительно-ласкательными суффиксами. В центральной России чаще встречается вариант Бабушин как притяжательное прилагательное к «бабуша» — то есть «чей?» — бабушин, сын или человек Бабуши.

Само слово «бабуша» в старых говорах могло означать не только «бабушка» (в уменьшительной форме), но и прозвище для пожилой женщины, либо, что важнее, для мужчины, которого в шутку или по поведению сравнивали с бабкой — например, за ворчливость, медлительность или привычку ухаживать за внуками. В ономастике известны случаи, когда «бабскими» прозвищами наделяли мужчин, занимавшихся женскими ремеслами (повитух, нянек), или просто тех, кто жил в доме свекрови и находился под её влиянием.

Есть и вторая, менее очевидная версия: в южнорусских и украинских диалектах «бабуша» — это разновидность головного убора (платок, косынка). Прозвище могли дать торговцу платками или портному, шившему такие уборы. Однако эта гипотеза слабее, потому что фамилии от названий одежды обычно образуются через суффикс -ник (Бабушечник, Бабушин — исключение), а географически фамилия Бабушин чаще фиксируется в центральных и северных областях России, где «бабуша» в значении «платок» почти не употреблялась.

По данным исторических документов, фамилия встречается в писцовых книгах XVI–XVII веков в Новгородской и Псковской губерниях, что подтверждает её северо-западное происхождение. В отличие от массовых фамилий на -ов, Бабушин осталась относительно редкой — её носители, скорее всего, происходили из одного локального рода, где прозвище Бабуша закрепилось за основателем.

Таким образом, если вы Бабушин, ваши предки — не обязательно старушки. Скорее всего, это был мужчина с характером или занятием, которое окружающие связали с «бабьим» миром, либо просто человек, которого ласково называли «бабуша» — в значении «дедушка» или «старик», что тоже встречалось в диалектах.