Фамилия Бакунюк — характерный пример украинской модели фамилий на -ук/-юк. Этот суффикс в Западной и Центральной Украине (Волынь, Галиция, Подолье) выполнял роль отчества: он обозначал «сына» или «потомка» человека, чьё имя или прозвище легло в основу. То есть Бакунюк — буквально «сын Бакуна».

Корень «Бакун» мог произойти от нескольких источников. Самое очевидное — прозвище Бакун, которое в украинских говорах иногда давали болтливому человеку (от глагола «бакати» — болтать, тараторить). Но есть и другая, более конкретная версия: Бакун — это народное название растения багульник (Ledum palustre) в некоторых регионах Украины. В таком случае прозвище мог получить либо травник, знахарь, либо человек, живший в местности, где этого кустарника было много. Третья, менее вероятная гипотеза — связь с именем Бакун как формой канонического имени Вакх (в просторечии — Бах, Баха), но для украинской среды это редкость.

Фамилия Бакунюк почти не встречается в центральных и восточных областях России. Её ареал — западные области Украины (Ровненская, Волынская, Житомирская) и юг Беларуси. В дореволюционных записях она могла фиксироваться в вариантах Бакунюк, Бокунюк, а иногда и с «ять» на конце — Бакунѣвъ, если носитель оказывался в зоне польского или русского делопроизводства.

Интересно, что фамилия сохранила прозрачную словообразовательную структуру, несмотря на то что исходное прозвище Бакун уже вышло из активного употребления. Это редкий случай, когда суффикс -юк не стёрся, а чётко указывает на родство: любой Бакунюк — потомок человека, которого в XVI–XVII веках знали как Бакуна.