Фамилия Балтийска — редкая и нестандартная для русского ономастикона. Вместо привычных суффиксов -ов, -ин или -ский мы видим окончание -а, свойственное скорее географическим названиям (Балтийск — город в Калининградской области). Скорее всего, перед нами не исконно русская фамилия в узком смысле, а позднее искусственное образование или фамилия, возникшая из прозвища по месту жительства.

Самая прямая версия: фамилию могли получить выходцы из города Балтийска (бывший Пиллау). В советское время, после переименования города в 1946 году, переселенцы или военные, прибывшие оттуда, могли получить прозвище «Балтийский», которое со временем закрепилось в документах в форме Балтийска. Окончание -а здесь может указывать на женскую форму фамилии (как у украинских или белорусских фамилий на -а), либо на то, что фамилия была записана в родительном падеже от названия (из Балтийска → Балтийска). В русской традиции фамилии на -а без суффикса часто имеют западнославянское или балтийское происхождение.

Есть и другая, менее вероятная, но возможная версия: основа «балт-» (от названия Балтийского моря или балтийских народов) и суффикс -ийск- с окончанием -а. Такие фамилии могли давать семинаристам в духовных училищах — по красивым, книжным топонимам. Однако форма Балтийска в мужском роде нехарактерна для семинарских фамилий (обычно Балтийский), поэтому версия с женской фамилией или с ошибкой в документах выглядит убедительнее.

Фамилия практически не встречается в исторических источниках до XX века. В современных базах данных носители Балтийска живут в основном на северо-западе России и в Прибалтике, что подтверждает связь с одноимённым городом. Если вы носите эту фамилию, ваши предки, скорее всего, были связаны с Балтийском — либо как военные моряки, либо как переселенцы после войны.